سید محمد حسینی خامنه (زاده ۳ دی ۱۳۱۴ در مشهد) معروف به سید محمد خامنهای حقوقدان، مجتهد و مدرس دانشگاه ایرانی است. وی برادر بزرگتر رهبر معظم انقلاب و از تدوینکنندگان پیشنویس قانون اساسی جمهوری اسلامی ایران است.
محمد خامنهای نماینده مشهد در دوره نخست مجلس خبرگان قانون اساسی بود. وی همچنین در دوره اول و دوم مجلس شورای اسلامی، به عنوان نماینده مشهد در مجلس حضور داشت.
